O processo de acreditação é voluntário, ou seja, é a organização, serviço ou programa da saúde que manifesta o interesse em ser avaliado. A avaliação é realizada pelas Instituições Acreditadoras Credenciadas pela ONA, tendo como referência as normas do Sistema Brasileiro de Acreditação e o Manual Brasileiro de Acreditação.
Em 2005 a Santa Casa de São José dos Campos realizou o Diagnóstico Organizacional.
Diagnóstico é a atividade de avaliação das organizações, serviços e programas da saúde sem fins de certificação, por meio da aplicação da metodologia da ONA. O processo é desenvolvido por avaliadores habilitados e qualificados que compõem a equipe da Instituição Acreditadora Credenciada. Ao final, a organização recebe uma Declaração de Diagnóstico Organizacional emitida pela ONA.
